OxfordNanopore開發（fā）連（lián）接智能咗

Oxford Nanopore開發連接智能的（de）納米孔測序儀

訊

牛（niú）津納米孔技（jì）術公司透露，正在開發一（yī）種連接智能使用的納米孔傳感器，用於DNA測序和其他應用中。公司（sī）還對其他研發中的新產品（pǐn）進行了介紹。另外，該公司成立了一家分公司，名為GenomeFoundry，關注合成生物學的應用。

開發連接智能使用的納米孔儀器（qì）SmidgIon

公司首（shǒu）席技術官CliveBrown透露，這款新型納米孔儀器稱作SmidgIon，正處於（yú）早期研發階段，預計在2017年末可以投入使用。該產品同（tóng）樣將（jiāng）使用應用於MinIon和PromethIon儀器的核心納米孔傳感技術，但是該儀器將比MinIon更小，每個flowcell中有256個channel，可以（yǐ）連接到智（zhì）能上或（huò）者其他低功率儀器上，用於感（gǎn）應DNA、RNA或蛋白質。

據公司透露，SmidgIon可應用於更（gèng）加廣泛的領域，包括疾病（bìng）爆發中的病原（yuán）體監測（cè），分析環境樣本或者（zhě）農業樣本，對於野生動植物或木材（cái）進（jìn）行實時物種（zhǒng）鑒定。

其他正在開發中的產品

Brown說，另一個（gè）處（chù）於早期研（yán）發階段的產品稱作ProjectZumbador，該產品將生物學樣本的核酸提取和（hé）文庫製（zhì）備結合但是每種製品所要求的材料特性不1到一個（gè）設備中，將在第三季度發布。

公司同時還在研發MinIon和PromethIon上直接進行RNA測序的kits，這項產品計（jì）劃在接下來的幾個月內提供（gòng）給。公司表示，該產品可利用adapter和馬達蛋白控製RNA移（yí）位，指導RNA進入納米（mǐ）孔。Oxford使用這種（zhǒng）方法已經對來自（zì）人類鼻病毒的（de）RNA進行了測序，並表示直接進行RNA測序可（kě）以檢測到RNA上的甲基化修飾。

另外一個產品VolTrax是一款樣本製備儀器，將（jiāng）在今年秋天提前（qián）供應給目前使用Oxford納（nà）米孔（kǒng）測序平台的客戶。公司表（biǎo）示，便於操縱首批發布的儀器VolTrax將依附在一個小（xiǎo）型（xíng）USB儀器上（shàng），然後附著於MioIon或者PromethIon儀器上（shàng）。

OxfordNanopore同樣還計劃不（bú）久後實現進口下滑其實不意味著國外裝備使用（yòng）率降落MinKonw平台堿基識別軟件的本地使用（yòng）。

台PromethIon近期已經（jīng）出貨

Brown說，台PromethIon近（jìn）期已經出貨（huò）給客戶了，他還展示了該平台的一些（xiē）內部數據，共使用了48個flowcell，每（měi）個（gè）flowcell中含有3000個channel。使用R9試劑，每個納米（mǐ）孔每秒測（cè）序250個堿基，準確率和小孔利用率都與MinIon一致。該係統目前的性能是運行48小時產生6.2Tb數據，將來會進（jìn）一步增加至12.4Tb。根據Brown的報告，公司目前正在調試軟件用（yòng）於控製大型數據集的（de）堿基實時識別，優化芯片（piàn）表麵化學試劑以及生產流程，並（bìng）開發一種快速（sù）的堿基識別程序。

全（quán）部使用新型納（nà）米孔R9

除此之外，Brown表示，OxfordNanopore已經（jīng）不再出售R7納米孔（kǒng）的（de）flowcell，現在已經全部替換成R9納米孔的flowcell，R9即CsgG，近得到比利時VIB研究所和倫敦大學學（xué）院授權。Brown補充道，新（xīn）型的flowcell還整（zhěng）合了堅固的膜和一個更新的解旋酶馬達蛋白（bái）。公司使用新的flowcell測序（xù）得到的長讀長為500kb，目前主要關注於提升通量和同聚物識別能力。

公司在一份聲明中指出（chū），R9係（xì）統具有更高的準確率，尤其是對於1Dreads，這種reads僅讀取DNA的一（yī）條（tiáo）鏈。新型堿基識別軟件不同（tóng）於以往的隱馬爾可夫（fū）模（mó）型，它是基（jī）於神經絡模型（xíng），進一步提升了準確率。R9型flowcell測序時，每個納米孔每秒測序250個堿基，而R7型每秒多測定70個堿（jiǎn）基，因此公司表示換用R9型flowcell後MinIon將產出更多的數據。Brown說，目前1Dreads的準確（què）率為90，2Dreads準確率為95。

與（yǔ）R9型flowcell配套，公司正在推出一（yī）種快速測序（xù）kit。用該kit建庫隻需（xū）要10分鍾，而且使用的耗材比以前更（gèng）少，MinIon運行開始後馬上進行數（shù）據分析。公司聲明中表示，目前（qián）許多早期客戶（hù）正在測試這款快速測序kit，它將很快推出（chū）市場。

成立分（fèn）公司（sī）GenomeFoundry

Brown後提到了OxfordNanopore的一家新的分公司GenomeFoundry，該公（gōng）司旨在開發一種用於合成生物學的MinIon，使用專有的（de）、非（fēi）亞磷酰胺的DNA合成試劑。公司的目的是為了使用類（lèi）似於（yú）VolTrax的儀器開（kāi）發長（zhǎng）鏈DNA分子。